Python-远程-1个月
￥1-6K/月
技能要求:
Python
经验要求:
5-10年经验
程序员客栈
2022-07-19 19:20
工作描述:
项目编号：【140970】
需要撰写一个python脚本，在Linux系统中，对clustal omega序列比对的.aln格式结果文件，根据序列的比对结果文件找到选定序列的共有序列设计出2条引物和一条探针，满足引物（16-28bp）和探针（16-28bp或12-26bp）一定的长度序列、Tm值(58-62℃)、二聚体、发卡结构要求，同时这些引物探针不会结合到选定的排除序列中。输入的参数有引物长度（范围，一般16-28bp）、扩增子长度（引物间的距离）、探针长度（16-28bp或12-26bp、探针类别（taqman、MGB、LNA）；
需要撰写一个python脚本，在Linux系统中，对clustal omega序列比对的.aln格式结果文件，根据序列的比对结果文件找到选定序列的共有序列设计出2条引物和一条探针，满足引物（16-28bp）和探针（16-28bp或12-26bp）一定的长度序列、Tm值(58-62℃)、二聚体、发卡结构要求，同时这些引物探针不会结合到选定的排除序列中。输入的参数有引物长度（范围，一般16-28bp）、扩增子长度（引物间的距离）、探针长度（16-28bp或12-26bp、探针类别（taqman、MGB、LNA）；
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